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Introduction

This report assesses the ECA Bibliography in regards to different measures and shows some information of the content. It does not assess the content of the sources but rather the bibliometric data.

Cleanliness of the Bibliography

Cleanliness of a bibliography is defined here as the quality of the bibliografic data in the bibliography. It does not concern any topical measures, only measures related to the bibliografic data in the bibliography.

The analysis is at the moment only done for DOIs as corresponding measures are not available at the moment for ISBNs and ISSNs and duplicate ISBNs and ISSNs can be rcorrect as div=fferent chapters of a book might be in the bibliography.

Entries with DOIs, ISBNs or ISSNs in Zotero

To identify a reference, the most widely used identifier is the DOI. The following table shows the number of references with a DOI and the number of unique DOIs.

To consider duplicate ISBNs or ISSNs as duplicates entries in the library is not waranted as e.g. differenc chapters of a book can be separate entries in the library and therefore lead to duplicates.

• DOIs: 7617 (63.52%) - 1577 duplicates
• ISBNss: 774 (6.45%) - 218 duplicates
• ISBNss: 7310 (60.96%) - 6320 duplicates

DOIs in Zotero

The foilowing sections provide some more detailed analysis of the bibliography in Zenodo. The tables all contain clickable links which, shwen clicked, show the respective article in the Zotero bibliograpohy.

Duplicates

The following DOIs are duplicates in the bibliography. This table should be empty.

#|
data.frame(
  doi = bib_data$metrics$zotero_dois$duplicate,
  link = paste0(bib_data$bibliography$url, "/items/", names(bib_data$metrics$zotero_dois$duplicate))
) |>
  dplyr::mutate(
    doi = paste0('<a href="', link, '" target="_blank">', doi, "</a>"),
    link = NULL
  ) |>
  knitr::kable(
    caption = "DOIs in Zenodo which are duplicated",
    escape = FALSE
  )

DOIs in Zenodo which are duplicated

	doi
ZTNYPZPI	10.1163/187471611X600369
LAP9BWNL	10.1007/s10531-016-1131-9
IHMT2RGK	10.1126/science.1257553
ZBNTYJGR	10.1016/j.envsci.2012.10.006
62TPRJPA	10.1002/rse2.4
VMQXIKUI	10.1126/science.1253425
9YL6U4S4	10.1007/s10530-014-0817-8
AEMM997F	10.1016/j.forpol.2004.04.005
IT695W6Q	10.1016/j.ecoser.2015.10.023
ZRZPXUM6	10.1002/ehs2.1215
RRVGWMQK	10.1111/cobi.12531
E4H3XVE7	10.1111/ele.12082
V8PC94DN	10.1016/j.aaspro.2016.02.017
4T2Y44FR	10.1007/s10531-011-0141-x
77FSJANL	10.1016/j.agee.2016.05.018
4SWFU4EG	10.2307/2999742
GT4QHAHK	10.1016/j.ecss.2015.12.021
DMKW7UVK	10.1139/x2012-078
2S3UZL9V	10.1016/j.agee.2013.08.018
MR3LEE3V	10.1051/agro
R3CZHDAX	10.1371/journal.pbio.1002074
9PYRXGJB	10.1016/j.ufug.2016.11.002
MVBDW7YP	10.1016/j.ecoser.2013.04.002
4Z6YYZN2	10.1038/ncomms12485
5RKRK8NU	10.1007/s13280-014-0505-z
YK86K4BN	10.1016/j.gloenvcha.2015.04.013
GJNVAZRC	10.1016/j.ecolecon.2014.09.029
Z236Z3C2	10.1371/journal.pone.0067737
Z8X2TSI6	10.1007/s13280-014-0556-1
L49ERL6I	10.1111/j.1365-2664.2008.01600.x
PYF9T867	10.1016/j.jnc.2016.03.001
2EUNUJ8V	10.1007/s10980-014-0085-0
KCPZZPRV	10.1016/j.ecolind.2013.03.003
DJDRLN6L	10.1111/1365-2664.12219
UTWRC8ZB	10.1080/03066150.2011.559010
85ZMZHFL	10.1016/j.ecolind.2014.04.018
7CCA7B7X	10.1016/j.jaridenv.2008.11.013
L5TCP6RB	10.1016/j.landusepol.2014.12.012
SAKFSPGD	10.1111/j.1365-2664.2007.01306.x
GPZFML5D	10.1016/j.cosust.2014.11.002
GVDF2NSU	10.1016/j.clipol.2003.10.004
WYW4TFHI	10.1038/495305a
SELYLHY8	10.3402/iee.v5.30082
2KV99IEK	10.1016/j.scitotenv.2016.11.106
YVJS9BBR	10.1016/j.ecolind.2013.07.014
IBAH4TRQ	10.1016/j.landusepol.2012.12.013
2N5XFD7K	10.1016/j.forpol.2017.03.013
URHRHTT8	10.1016/j.ecoser.2012.12.002
YFM4P35U	10.1016/j.ocecoaman.2016.07.005
7LLMKLIP	10.1007/s13593-013-0183-4
A9JBN4VB	10.1371/journal.pone.0074989
K4L36IE6	10.2111/REM-D-13-00082.1
ZPTY5B7H	10.1016/j.gloenvcha.2014.04.002
TQICIPX4	10.1111/j.1461-0248.2005.00869.x
TMSQ6HHM	10.1371/journal.pone.0038970
2UXN3B3L	10.1016/j.forpol.2016.10.008
5WREW3T2	10.1016/j.gloenvcha.2014.07.005
HX8HFGWF	10.3390/w7094657
M5HADCXQ	10.1038/461472a
TEBGCTA6	10.1016/j.ecoser.2015.10.014
V55XBZQK	10.5751/ES-05597-180333
MD2WNKMK	10.1016/j.marpolbul.2015.09.054
YKM97RKT	10.1016/j.biocon.2016.08.041
3PXY3CK4	10.1093/biosci/biw101
YJTNMU3K	10.1111/j.1523-1739.2009.01283.x
IXDDSVDW	23
4NI54J4A	10.1016/j.cosust.2013.01.002
JUNXFZ43	10.1007/s10531-015-0971-z
4ZJUXPCJ	10.1016/j.geoforum.2015.03.004
54C7RY28	10.1016/j.ecolecon.2014.09.028
JDBYXV69	10.1890/15-0016.1
ZACK3ZMS	10.1098/rspb.2010.1923
7AEJEQDN	10.1002/eet.1760
DYX2R6NJ	10.1016/j.ecolecon.2010.04.017
2P6AMMG3	10.1068/c09196
SNUK4EUB	10.1016/j.ecolind.2015.03.029
LG32QU7T	10.1111/j.1477-8947.2009.01217.x
F9V9KP45	10.1111/j.1365-2664.2011.02069.x
QA4HDI4P	10.5751/ES-06401-190227
N8QUSSW3	10.1016/j.ecolind.2012.08.005
3GNPXL4R	10.1016/j.biocon.2014.02.013
M7PFX25P	10.1111/ele.12128
MJ8S67Q5	10.1016/j.biocon.2016.05.007
Z6H2W3WW	10.1371/journal.pone.0082996
6YUNDHG2	10.1016/j.cosust.2016.12.006
VIZMCNB7	10.1007/s10113-013-0414-x
JSBCYEKK	10.1016/j.ecolind.2012.06.025
BIBAE7UI	10.1016/j.landusepol.2015.07.003
SZM2B5JU	10.1016/j.ecolind.2015.11.032
7UI8GSSX	10.1016/j.forpol.2015.07.002
QX73LBGM	10.1126/science.1234379
A343P68V	10.1007/s10745-011-9427-6
HNVQYE7A	10.1016/j.landusepol.2008.08.011
3FW5JC3V	10.1016/j.agee.2007.09.005
GRHDVI2X	10.1111/j.1365-2664.2005.01005.x
9NNPHUFW	10.1016/j.landusepol.2016.11.006
XXCQXJRX	10.2981/wlb.00011
S3E7J5U6	10.1016/j.envsci.2015.10.001
8ECLINHE	10.1659/0276-4741(2003)023[0119:spmika]2.0.co;2
8WR5GYRX	10.1007/s10344-011-0606-y
JCZN2H6T	10.1080/09637480701566495
9JMU2CYL	10.1111/een.12207
MU8UQSJE	10.1080/00139157.2014.861673
GM5S9VN7	10.1080/03949370.2014.916352
EEFCMHM3	10.3390/su7067644
W5PFRXAH	10.1017/s0030605310001547
D256CA6B	10.1088/1748-9326/7/2/024021
63GXG7RJ	10.1007/s10344-008-0236-1
2LF5FNP8	10.1007/s00267-005-0342-8
RCRJPS6Q	10.1007/s13280-012-0371-5
TRBSGI9R	10.1080/03949370.2014.986768
ISVWAPGT	10.1016/j.envsci.2015.12.003
AEVLEBB3	10.2192/1537-6176-19.2.146
VUYLE3SJ	10.1016/j.gloenvcha.2013.05.001
ECJMZAQA	10.1016/j.ecoser.2016.09.018
GDYV8DFK	10.1007/s00267-016-0724-0
5WQNDRTZ	10.12775/eq.2014.008
AC5KCBPZ	10.1007/s13364-015-0250-0
T5M7Z4YM	10.1007/s10980-014-0048-5
8N29THLL	10.7717/peerj.1545
G4QLWFLC	10.1177/0013916509338147
9ULDI4SM	10.1007/s13280-012-0367-1
3TJHVB7E	10.1016/j.biocon.2003.10.015
PL9YC42S	10.2981/0909-6396(2008)14[188:pebmms]2.0.co;2
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QU6IIZGT	10.1016/j.ecolind.2015.10.023
CKUZZWGN	10.2192/ursus-d-12-00016.1
GJPLM4N5	10.2981/wlb.00098
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X58ERX2H	10.1007/s10531-013-0582-5
DTFPXQ2A	10.1080/21513732.2012.695229
93Q4VRBK	10.1016/j.landurbplan.2015.08.008
JMUNBAEN	10.1515/mammalia-2014-0151
PP9KXECF	10.1017/S0376892914000125
EBRF8J7D	10.1007/s10531-009-9657-8
IYHJWVAE	10.1038/srep23198
YAH2GXC9	10.1016/j.ecolecon.2012.08.017
GJ5XND9Z	10.1007/s13280-015-0674-4
W5DSKPJD	10.1111/ddi.12288
Z74W8T8A	10.1016/j.ecolecon.2015.01.006
IZHUTBMV	10.1016/j.ecolind.2015.08.050
9S9ARZCA	10.1016/j.forpol.2015.12.002
VGIAG8WY	10.1126/science.1257484
DMD3BN78	10.1111/ddi.12002
7AKUC4SX	10.1111/j.1523-1739.2009.01401.x
NL2T5MQT	10.1111/j.1365-2664.2012.02119.x
KUGF8245	10.1016/j.envsci.2016.01.007
VHF67F8B	10.1016/j.ecoser.2016.06.010
HCCS3EEY	10.1111/jzo.12088
4LJMXAMR	10.1080/13504622.2010.505442
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F3QWYADY	10.1016/j.ecoser.2016.08.001
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9QI6GGX6	10.1016/j.ecoser.2014.04.002
2NZ7LEG8	10.1080/10871209.2011.535240
C9KNK8ME	10.1016/j.scitotenv.2016.10.147
GHJAUAEN	10.2192/ursus-d-12-00031r1.1
IP9C8SMQ	10.1111/j.1755-263X.2011.00217.x
AIENHFU9	10.1016/j.gloenvcha.2013.11.022
6JZKB2JG	10.1016/j.biocon.2016.02.027
MDVIWH8M	10.1016/j.biocon.2015.02.034
GSXLEP6W	10.1016/j.forpol.2010.06.003
3AY2XVLM	10.1002/ieam.1782
M6Q6E47Z	10.1080/13501763.2013.834547
F3XPRR6N	10.2981/wlb.00068
D9GUXH6K	10.1016/j.envsci.2012.07.027
NR4R6ZD2	10.1071/WR11077
NUUN64VR	10.1007/s10344-014-0845-9
BA2LVM3D	10.2981/wlb.13116
SH9QA7ED	10.1007/s10344-013-0754-3
5GVDZNUZ	10.1111/1365-2664.12047
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J8H8TC2K	10.2981/09-059
PEWRXUHZ	10.2192/ursus-d-10-00016.1
GXWMA9HG	10.1007/s12665-016-5753-8
ZPH3WDAF	10.1007/s10344-005-0018-y
EU4GX72N	10.4404/hystrix-23.1-4560
2KB3EN8V	10.1007/s10531-016-1117-7
QGN7N8BU	10.5194/hess-17-5141-2013
7UPMFZI8	10.1016/j.jnc.2015.03.007
C8TM98VW	10.5751/es-00672-090304
DTU2HNNZ	10.2112/si61-001.14
62PCPMTA	10.2193/2006-368
NSP32ID7	10.1080/08927936.2015.11435399
DBIBN7I3	10.1016/j.ecolind.2013.11.010
YIRPMJ2A	10.5751/ES-03476-150318
Z6NWDH8U	10.1111/cobi.12420
BC88IAPH	10.1007/s00267-010-9455-9
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Q5GQWYYI	10.1002/jwmg.424
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B6CD547M	10.1016/j.jglr.2009.11.007
2T7MGPHL	10.1007/s10584-014-1239-4
W54HCJLS	10.1007/s00035-011-0094-4
8CKD6IY5	10.1016/j.landusepol.2012.12.012
AW6JIMAP	10.5751/ES-05619-180307
IMS2PY3S	10.1016/j.baae.2009.12.001
TINIJ6ZG	10.1016/j.scitotenv.2013.08.061
S59SKGGJ	10.1016/j.marpolbul.2006.12.003
7AJX92BA	10.17099/jffiu.48603
BAHPD2PG	10.1016/j.biocon.2006.02.008
5KMLI2MW	10.1016/j.ecoser.2012.07.012
SRE7FSKK	10.1080/02827580701804179
U6IVS3JU	10.1016/j.bse.2014.01.012
SVPUX6YI	10.1007/s10531-016-1131-9
TB43WE2K	10.1038/nature15743
B3EG9G9J	10.1016/j.envsci.2012.07.027
ZN29JKFB	10.1111/1365-2664.12696
C9547ILM	10.1093/biosci/biw101
GZFVSXW6	10.1016/j.ufug.2015.07.008
E5VZGDGB	10.2779/39229
44MV6G6Z	10.1016/j.ecolind.2012.08.005
XVHM3VFY	10.1016/j.agrformet.2009.08.006
9L5MFIGQ	10.1038/nclimate1687
CUH2YB7S	10.1016/j.ecoser.2014.06.004
SRF97YPX	10.1016/j.agee.2016.05.018
7WF3XVWJ	10.18352/ijc.367
WV5VR82F	10.1111/ddi.12288
96SNHA2Z	10.1186/s13002-015-0036-0
U7KGMSGH	10.1038/nature08823
FAIHNSBL	10.1155/2012/156846
ATZR6Z8T	10.1111/gcbb.12179
GUKLX8WQ	10.1046/j.1365-2664.2002.00695.x
ENBNA8ZB	10.1007/s12231-008-9037-4
U5KZ62ZQ	10.1016/j.foreco.2007.05.030
ITG6C5Z5	10.1016/j.foreco.2013.04.012
SQBEGQXY	10.1080/02827581.2003.9728293
G8AI5DK2	10.1007/s10531-016-1141-7
R5VPQQVF	10.1007/s10344-015-0940-6
IML4VJML	10.1016/j.agee.2013.08.018
QEIXAP74	10.1016/j.ecoser.2012.07.012
R2AIID9Q	10.1371/journal.pone.0067737
YUW96SZC	10.1025/bio.2009.59.3.7
XGEFQDS3	10.1006/jema.1999.0335
CFX7JBQY	10.1111/gcb.12644
23AV2Q8T	10.1016/j.ecoser.2015.10.023
N94KNCX7	10.1016/j.ecoser.2012.06.004
PBWWQ4BL	10.1016/j.biocon.2012.06.016
DYGQ26WT	10.1016/j.landurbplan.2007.02.001
Z4ZF2QW5	10.1073/pnas.1517903113
XQTAFGL6	10.1038/ncomms11109
W5GWDLRP	10.1016/j.ecolind.2012.01.012
B3LNNESB	10.1007/s10841-006-6293-4
59W85QST	10.1126/science.1152509
QTUTKQUQ	10.1016/j.scitotenv.2009.05.002
N68K7Z2C	10.1016/j.enpol.2010.03.030
VKH634T8	10.1146/annurev.ecolsys.110308.120159
BJFSPKTN	10.1016/j.jmarsys.2013.06.005
T9W9VN7X	10.1111/j.1466-8238.2010.00607.x
KZ55G3MT	10.1890/08-1140.1
TJQIFMBF	10.1016/j.agee.2005.11.006
ALTE64NT	10.1126/science.1234379
4669PLP8	10.1016/j.ecoser.2016.06.006
4NM89L86	10.1016/j.ecoser.2016.10.006
LS6I74C2	10.2134/jeq2011.0439
4X8HHY5E	10.1016/j.ecoser.2017.02.014
PAUP8G3L	10.1016/j.jenvman.2009.07.005
UY6ZHA52	10.1016/j.landurbplan.2013.09.002

Non Standard

All DOIs should be given as only the DOI without the resolver, i.e. not starting withhttp`. The following table shows all entries which do have a non-copnform DOI:

#|

http <- grep("http", bib_data$metrics$zotero_dois$id_raw)
data.frame(
  doi = bib_data$metrics$zotero_dois$id_raw[http],
  link = paste0(bib_data$bibliography$url, "/items/", names(bib_data$metrics$zotero_dois$id_raw)[http])
) |>
  dplyr::mutate(
    doi = paste0('<a href="', link, '" target="_blank">', doi, "</a>"),
    link = NULL
  ) |>
  knitr::kable(
    caption = "DOIs in Zenodo which include a `http`",
    escape = FALSE
  )

DOIs in Zenodo which include a http

	doi
R6UYILZI	http://eur-lex.europa.eu/legal-content/EN/TXT/?uri=CELEX:32006L0118
JSPVP5K8	http://ec.europa.eu/clima/policies/international/negotiations/paris/index_en.htm
ISVWAPGT	http://dx.doi.org/10.1016/j.envsci.2015.12.003
7IJQGZMM	http://conventions.coe.int/Treaty/en/Treaties/Html/176.htm
E66G8EJW	http://dx.doi.org/10.1016/j.biocon.2011.11.001
DRFUZC4Q	http://dx.doi.org/10.1016/j.agee.2009.05.012
IG6R87YI	http://dx.doi.org/10.1016/j.jmarsys.2015.07.006
YIMPQGK3	http://dx.doi.org/10.2305/IUCN.UK.2006.RLTS.T61454A12488658.en
BL42AHVL	http://www.nature.com/nclimate/journal/v3/n1/abs/nclimate1627.html#supplementary-information
PG5G9R6W	http://dx.doi.org/10.2305/IUCN.UK.2009.RLTS.T164583A5910262.en
W4BYUA65	10.1038/nature16144 http://www.nature.com/nature/journal/v528/n7580/abs/nature16144.html#supplementary-information
IV6ZR4VU	http://www.nature.com/nature/journal/v475/n7354/abs/475036a.html#supplementary-information
5S28VQ9P	http://dx.doi.org/10.1093/femsle/fnv188
VE53T7GJ	http://dx.doi.org/10.1016/j.tree.2013.11.004
74TTCPVT	http://dx.doi.org/10.1016/j.ecss.2016.03.015
FCE2E5ZU	10.1038/ncomms14435 http://www.nature.com/articles/ncomms14435#supplementary-information
HQBZAVTR	https://www.pik-potsdam.de/ateam/avec/paper_russo.pdf
JVDJ3SJF	http://dx.doi.org/10.1016/j.biocon.2003.12.008
6ZT4GCDT	http://dx.doi.org/10.1016/j.foreco.2006.02.009
H8Y8S7CM	http://dx.doi.org/10.1016/S0169-2046(03)00094-X
PMPTWIAZ	http://dx.doi.org/10.1016/j.jmarsys.2009.12.014
U24VTIR9	http://dx.doi.org/10.1016/j.pocean.2010.09.005
ZWDQ22WW	10.1038/nature13717 http://www.nature.com/nature/journal/v513/n7517/abs/nature13717.html#supplementary-information
3TM8A3ID	http://dx.doi.org/10.1016/j.marenvres.2012.12.008
KKLAXUK4	http://dx.doi.org/10.2305/IUCN.UK.1996.RLTS.T22200A9364253.en
GVG9DK4H	http://dx.doi.org/10.1016/j.pocean.2004.02.017
R2I638UU	http://dx.doi.org/10.1016/S1146-609X(02)01145-1
M24DS7GT	http://dx.doi.org/10.1016/j.tree.2004.10.004
W9M8ZKY3	http://dx.doi.org/10.1016/j.biocon.2011.02.003
WG9LXRZV	http://dx.doi.org/10.2305/IUCN.UK.2009.RLTS.T164759A5923724.en
YAF7DQW7	http://dx.doi.org/10.2305/IUCN.UK.2009.RLTS.T164647A5915480.en
ZG5DDSIL	http://doi.org/10.1560/IJES.58.1.41
5JV4J9TW	http://dx.doi.org/10.1016/j.envsci.2015.12.003
P53IJH2V	10.1016/j.amepre.2015.01.017 LK - http://sfx.aub.aau.dk/sfxaub?sid=EMBASE&issn=18732607&id=doi:10.1016%2Fj.amepre.2015.01.017&atitle=Neighborhood+Environments+and+Socioeconomic+Inequalities+in+Mental+Well-Being&stitle=Am.+J.+Prev.+Med.&title=American+Journal+of+Preventive+Medicine&volume=49&issue=1&spage=80&epage=84&aulast=Mitchell&aufirst=Richard+J.&auinit=R.J.&aufull=Mitchell+R.J.&coden=AJPME&isbn=&pages=80-84&date=2015&auinit1=R&auinitm=J
CRZBIV6W	http://dx.doi.org/10.1016/j.landurbplan.2013.09.013
62EHI86C	http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0159545
KKVRCNRU	http://dx.doi.org/10.1038/ngeo233
6THCY95S	https://doi.org/10.1080/00139157.2014.861673
BUMU2VXR	https://doi.org/10.1016/j.tree.2011.08.006
4QX7YJ4J	http://dx.doi.org/10.1080/15387216.2017.1295876
SQVQVWVS	https://doi.org/10.1016/j.worlddev.2016.12.030
5XG4A7JG	http://dx.doi.org/10.1016/j.foreco.2011.04.004
WK392FV5	http://dx.doi.org/10.1016/j.seares.2015.06.020
B74VUUPF	http://dx.doi.org/10.1016/j.biocon.2011.12.035

Not Valid

Here we do acheck for the structural validity of the dois. This check needs to be improved. Of these 880 are not valid. These are:

#|

data.frame(
  doi = bib_data$metrics$zotero_dois$not_valid,
  link = paste0(bib_data$bibliography$url, "/items/", names(bib_data$metrics$zotero_dois$not_valid))
) |>
  dplyr::mutate(
    doi = paste0('<a href="', link, '" target="_blank">', doi, "</a>"),
    link = NULL
  ) |>
  knitr::kable(
    caption = "DOIs in Zenodo which ar not valid",
    escape = FALSE
  )

DOIs in Zenodo which ar not valid

	doi
BYWNMBQK	10.1579/0044-7447(2007)36[545:CBBCAH]2.0.CO;2
T7LYLN8M	32
UMSXXJQY	10.1890/1051-0761(2000)010[1251:ROTEKA]2.0.CO;2
4HFNA4BU	Available online: www.colorado.edu/journals/cye
R6UYILZI	http://eur-lex.europa.eu/legal-content/EN/TXT/?uri=CELEX:32006L0118
JSPVP5K8	http://ec.europa.eu/clima/policies/international/negotiations/paris/index_en.htm
7PBUI9UX	10.1371/journal. pone.0132232
IXDDSVDW	23
ZF4L937H	10.1890/1540-9295(2006)004[0045:TGACET]2.0.CO;2
8ECLINHE	10.1659/0276-4741(2003)023[0119:spmika]2.0.co;2
PL9YC42S	10.2981/0909-6396(2008)14[188:pebmms]2.0.co;2
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7CSE77J5	10.1890/0012-9658(2000)081[0607:EAROMA]2.0.CO;2
WLUNBNQ9	2036
PZQJ5X5T	10.1890/0012-9658(2001)082[1999:bcawpe]2.0.co;2
DAPJ5PXU	10.1554/0014-3820(2002)056[2383:pbwgbt]2.0.co;2
WHLKHTIW	10.1672/0277-5212(2006)26[79:teoalu]2.0.co;2
QS2VCRNR	10.1139/x06-166|issn 0045-5067
FW7B3LPR	ICES CM 2014/ACOM:10
799JIWBA	10.1641/0006-3568(2002)052[0473:SEATFB]2.0.CO;2
SVPH8MTN	10.1890/0012-9658(2006)87[1234:TIOPOT]2.0.CO;2
JB36CKJH	10.1890/1051-0761(1999)009[1439:fitcop]2.0.co;2
JFW5MUSU	10.1111/j.1365-2745.2007.01319.x|ISSN 0022-0477
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Not in OpenAlex

To validate the existence and validity of the DOIs, we check if the DOIs are in the OpenAlex database.

Of the 7617 unique DOIs in the library, 880 (11.55%) are in not in OpenAlex. This includes the non-valid DOIS, whci are filtered out in the table below.

data.frame(
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    escape = FALSE
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DOIs in Zenodo which ar not in OpenAlex

	doi
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YYQDY5WH	10.5751/ES-07489-200230
QBVM7769	10.1016/S0022-1694(02)00142-7
76Q58QQZ	10.5751/ES-05790-180344
X8BATCRT	10.1023/A:1022808908500
VF7SZW48	10.1029/2010GL042468
E5VZGDGB	10.2779/39229
S7RAASMB	10.3929/ethz-b-000238666
GRIHRSEB	10.1016/0169-2046(95)93251-J
ZJDUJPNR	10.1007/BF02471975
9X5CJHMQ	10.1016/S0378-1127(01)00496-0
96GYUXZ3	10.1071/AR9580553
3IB5SSZM	10.1016/S0169-2046(03)00100-2
JUWCW66Q	10.1016/S0169-2046(00)00082-7
QT4A5H94	10.1023/A:1008085902053
99B7Z6Z7	10.1016/S0378-1127(97)00026-1
NKIVCBB5	10.1111/j.1654-109X.2009.01060.x
RLP93E3S	10.1016/0167-8809(91)90052-Y
LS62RNUM	10.1023/A:1011115921050
2KS5FZVE	10.1023/B:BINV.0000022140.07404.b7
UA4QFFNF	10.1111/j.1526-100X.2009.00530.x
P9LLHLZU	10.1016/S0300-9629(76)80010-2
M6ZDHBEQ	10.1016/S0167-8809(99)00047-X
A6GX2QM6	:10.1016/j.jtbi.2010.03.032
F4LL5SQA	10.1007/s00267-003-0017-2|ISSN 0364-152X
YUW96SZC	10.1025/bio.2009.59.3.7
8M4J8SED	10.1111/j.1461-0248.2007.01149.x|ISSN 1461-023X
5NI4RSR3	ISBN: 978-92-1-126398-5
5XG4A7JG	10.1016/j.foreco.2011.04.004
WK392FV5	10.1016/j.seares.2015.06.020
RNFHYG35	10.1016/S1290-0796(01)90006-9
B74VUUPF	10.1016/j.biocon.2011.12.035
XM82JY5P	10.2307/27647687
C97Z7PCA	10.1175/JCLI3471.1
U7LZD4GZ	10.5751/ES-05576-180335
6N4BS59M	10.17660/ActaHortic.2007.729.83
NZGLTCB3	10.1515/gospo-2015-26
MY4D56JS	10.1111/j.1467-923X.2010.02133.x
6METTBQ6	10.5751/ES-05927-180237
WUQL85LN	10.1111/j.1755-263X.2012.00270.x

TODO Do Exist

TODO Finally we check, if these dois exist but are not ingested into OpanAlex. This is done using the doi.org resolver This is disabled at the moment and still needs o=to be implemented.

Bibliographic analysis

In the bibliographic analysis, we can only analyse the references in OpenAlex as the bibliographic metadata alanised is not in the Zotero liubrary but retrieved from OpenAlex.

Publication types

Works on Zenodo as well as on OpenAlex are of different types. Here we show these separate.

bib_data$figure_types_data |>
  dplyr::arrange(
    from,
    desc(count)
  ) |>
  knitr::kable(
    caption = "Types of documents from the Zotero bibliography as well as from OpenApex."
  )

Types of documents from the Zotero bibliography as well as from OpenApex.

type	count	from
article	6572	OpenAlex
review	570	OpenAlex
book-chapter	44	OpenAlex
letter	38	OpenAlex
preprint	30	OpenAlex
book	18	OpenAlex
erratum	8	OpenAlex
dataset	4	OpenAlex
other	4	OpenAlex
editorial	2	OpenAlex
paratext	1	OpenAlex
report	1	OpenAlex
journalArticle	9235	Zotero
book	1334	Zotero
report	761	Zotero
bookSection	504	Zotero
conferencePaper	76	Zotero
manuscript	44	Zotero
thesis	37	Zotero

bib_data$figure_types

Zenodo versus OpenAlex Types

The types entered in the Zenodo library and the types as retrieved from OpenAlex are not linked, therefore they can differ, This can indicate problems but not necessarily has to. These cases need to be carefully evaluated and here only a starting point is given.

NA in OpenAlex is likely caused by the doi not found in OpenAlex (not in there, not valid, non-standard DOI in Zenodo). NA in Zotero is linked to non-standard DOI entries (i.e. with http) whcih can therefore not be linked to OpenAlex data. If all DOIs are in standard format, there should be no NAs in this Table in the column Ferom Zenodo.

Improvements should be done after feedback.

bib_data$metrics$types$comparison |>
  knitr::kable(
    col.names = c("Type from Zenodo", "Type from [OpenAlex](https://OpenAlex.org){target='_blank'}", "count"),
    caption = "Table giving the combination of types from Zenodo as well as [OpenAlex](https://OpenAlex.org){target='_blank'} and their frequency"
  )

Table giving the combination of types from Zenodo as well as OpenAlex and their frequency

Type from Zenodo	Type from OpenAlex	count
journalArticle	article	7704
journalArticle	NA	2513
book	NA	1334
journalArticle	review	794
report	NA	761
NA	article	537
bookSection	NA	504
conferencePaper	NA	66
manuscript	NA	44
journalArticle	letter	44
thesis	NA	37
journalArticle	book-chapter	35
journalArticle	preprint	33
NA	review	28
journalArticle	book	18
journalArticle	erratum	14
NA	book-chapter	10
conferencePaper	article	9
journalArticle	other	6
NA	dataset	3
conferencePaper	book-chapter	1
journalArticle	paratext	1
journalArticle	dataset	1
journalArticle	editorial	1
journalArticle	report	1
NA	preprint	1
NA	editorial	1

Year of Publication

bib_data$figure_pub_year

Warning: Removed 1 row containing missing values or values outside the scale range
(`geom_col()`).

Access Status of References

This is checked by using the OpenAlex retrieved works. Therefore it is li=mited to the works that are on OpenAlex. At the moment, only references with a DOI were retrieved from OpenAlex.

bib_data$figure_oa_status

50 Most often cited Journals

Based on the data entered in the bibliography on Zenodo

bib_data$figure_top_journals

This table contains all Journals as specified in the Zotero database.

bib_data$figure_top_journals_data |>
  IPBES.R::table_dt("cited_journals")

Coutries of Institutes of all authors

In this section we will take a closer look at the countries from which ih the authors ot the publication come. THe data comes from OpenAlex and includes all authoirs without weighting.

#|
#| fig-height: 10
#| fig-width: 10

bib_data$figure_top_country_map

This plot only contains the countries with more than 10 references.

#|
#| fig-height: 10
#| fig-width: 10

bib_data$figure_top_country

This table contains all countries and the number of authorship.

bib_data$figure_top_country_data |>
  IPBES.R::table_dt("top_countries")